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GENMED

Publié le 26 octobre 2016

Le Laboratoire d'excellence en GENomique MEDicale, GENMED a pour objectif de promouvoir le développement de projets de recherche, sur des pathologies humaines, compétitifs à l'échelle nationale et internationale. Ainsi, GENMED évalue, développe et met en place, dans un environnement de production à haut débit, les technologies et méthodologies de nouvelle génération combinées à l'analyse intégrée des données de génomique.

Il est coordonné par le Dr. Jean-François Deleuze, Directeur Scientifique de la Fondation Jean Dausset-CEPH et Directeur du Centre National de Génotypage (CNG-IG-CEA). Il est co-piloté par le Pr. François Cambien, Directeur de Recherche émérite INSERM. GENMED résulte de la collaboration de trois partenaires,

  1.  la Fondation Jean Dausset-CEPH,
  2.  l'UMR_S-1166 INSERM/Université Pierre et Marie Curie, équipe « Génomique et pathophysiologie des maladies cardiovasculaires »,
  3.  le Centre National de Génotypage-IG-CEA.

 

GENMED est organisé autour de 4 axes principaux,

  1. L'utilisation de nouvelles approches, à haut débit, basées sur le séquençage de nouvelle génération incluant le séquençage de l'exome, de l'ensemble du génome, les analyses d'expression et les modifications épigénétiques,
  2.  L'étude de collections de taille adéquate très bien caractérisées du point de vue phénotypique pour assurer le succès des approches,
  3.  Le développement de la génomique fonctionnelle à haut débit pour explorer par exemple les conséquences fonctionnelles des variations génétiques ou épigénétiques identifiées par les approches à l'échelle du génome,
  4. Le développement, l'évaluation et la mise en place de nouvelles méthodes pour le traitement et le contrôle de qualité des données de type génomique, transcriptomique ou épigénomique ainsi que leur intégration en utilisant des méthodologies statistiques et bio-informatiques adaptées.

 

Les objectifs partagés de GENMED sont,

  1. Collaborer sur des projets à fort potentiel en génomique médicale,
  2. Valoriser les données générées,
  3. Favoriser les interactions et la communication entre les collaborateurs,
  4. Développer des synergies entre les équipes visant à enrichir GENMED.

 

GENMED bénéficie d'un financement de 10.8 millions d'euros sur une période de 8 ans, lui permettant de mener à bien 8 projets innovants dans les domaines de la médecine personnalisée et de la médecine translationnelle à l'échelle nationale et internationale. Ces projets concernent l'identification de nouvelles cibles ou de biomarqueurs dans plusieurs maladies, telles que l'autisme, la cardiomyopathie dilatée, les maladies rares, le cancer du sein ou la maladie d'Alzheimer. La stratégie mise en œuvre devrait pouvoir être déployée à d'autres pathologies et ainsi permettre des avancées majeures.

En particulier, GENMED soutiendra des projets patrimoniaux comme :

  1. le séquençage whole genome de plusieurs centaines d'individus français qui pourront être utilisés comme référence par l'ensemble de la communauté scientifique,
  2. le développement d'une base de données innovante favorisant le partage de l'information.

 

GENMED favorisera également l'éducation et la formation dans le domaine de la génomique médicale grâce à son partenariat avec l'UPMC et l'UEVE. Fort de ce portefeuille et de son réseau de partenaires, GENMED ambitionne d'être un acteur significatif de l'organisation de la médecine génomique en France.

En savoir plus sur GENMED:  www.genmed.fr

 

 Réunion de lancement du LABEX GENMED - CEA/IG/CNG